Makoto Misuhara estuda no colégio Shinonome, onde trabalhava em uma experiência especial. Jinnai é amigo de infância de Makoto, porém ele tem muita inveja do seu amigo, por tudo dar certo para Makoto e para ela não. Ao descobrir a experiência do seu amigo, Jinnai resolve sabotá-lo trocando todos os plugins da máquina. Makoto chega para impedir Jinnai mas a máquina entra em curto circuito e acaba transportando a eles, um professor, e a irmã de Jinnai para o mundo de El hazard. Nesse novo mundo Makoto e o professor acabam salva uma linda garota (a princesa) de insetos gigantes chamados bulgrons (onde mais tarde eles obedeceram a Jinnai). El-Hazard é uma antiga civilização escondida onde Makoto Mizuhara e seus amigos foram transportados pela deusa-demônio Ifurita. Em El-Hazard, Makoto descobre que não só ele como seus amigos também possuem poderes especiais. Agora a missão de Makoto será de acabar com os planos dos terríveis bugrons regidos por seu ex-colega de colégio Jinnai e também com a tribo fantasma que planeja controlar uma poderosa arma de El-Hazard "O Olho de Deus". 

El Hazard Wanderes